Protein–RNA interactions for Protein: O88447

Klc1, Kinesin light chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc1O88447 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc1O88447 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc1O88447 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc1O88447 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc1O88447 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc1O88447 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc1O88447 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc1O88447 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc1O88447 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc1O88447 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc1O88447 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Klc1O88447 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klc1O88447 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms