Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

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Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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