Protein–RNA interactions for Protein: O88174

Cd46, Membrane cofactor protein, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd46O88174 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd46O88174 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cd46O88174 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd46O88174 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd46O88174 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd46O88174 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd46O88174 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd46O88174 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd46O88174 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd46O88174 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd46O88174 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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