Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Vamp4O70480 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp4O70480 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms