Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb5O70309 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms