Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chrna4O70174 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna4O70174 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms