Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd70O55237 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd70O55237 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd70O55237 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd70O55237 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms