Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RngttO55236 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RngttO55236 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RngttO55236 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RngttO55236 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RngttO55236 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RngttO55236 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RngttO55236 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RngttO55236 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RngttO55236 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RngttO55236 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RngttO55236 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RngttO55236 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RngttO55236 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RngttO55236 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RngttO55236 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RngttO55236 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RngttO55236 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RngttO55236 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RngttO55236 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RngttO55236 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RngttO55236 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RngttO55236 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RngttO55236 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RngttO55236 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RngttO55236 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RngttO55236 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RngttO55236 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RngttO55236 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RngttO55236 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RngttO55236 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RngttO55236 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RngttO55236 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RngttO55236 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RngttO55236 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RngttO55236 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RngttO55236 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RngttO55236 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RngttO55236 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RngttO55236 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RngttO55236 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RngttO55236 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RngttO55236 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RngttO55236 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RngttO55236 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RngttO55236 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RngttO55236 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RngttO55236 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RngttO55236 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RngttO55236 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RngttO55236 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RngttO55236 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RngttO55236 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RngttO55236 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RngttO55236 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RngttO55236 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RngttO55236 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RngttO55236 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RngttO55236 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RngttO55236 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RngttO55236 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RngttO55236 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RngttO55236 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RngttO55236 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RngttO55236 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RngttO55236 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RngttO55236 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RngttO55236 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RngttO55236 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RngttO55236 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RngttO55236 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RngttO55236 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RngttO55236 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RngttO55236 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RngttO55236 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RngttO55236 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RngttO55236 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RngttO55236 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RngttO55236 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RngttO55236 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RngttO55236 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RngttO55236 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RngttO55236 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RngttO55236 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RngttO55236 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RngttO55236 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RngttO55236 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RngttO55236 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RngttO55236 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RngttO55236 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RngttO55236 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RngttO55236 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RngttO55236 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RngttO55236 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RngttO55236 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RngttO55236 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RngttO55236 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RngttO55236 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RngttO55236 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RngttO55236 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms