Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlx3O55144 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms