Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp2a2O55143 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp2a2O55143 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms