Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrxO55103 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrxO55103 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PrxO55103 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrxO55103 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrxO55103 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrxO55103 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrxO55103 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrxO55103 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrxO55103 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrxO55103 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrxO55103 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrxO55103 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrxO55103 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrxO55103 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrxO55103 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrxO55103 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PrxO55103 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrxO55103 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrxO55103 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrxO55103 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrxO55103 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrxO55103 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrxO55103 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrxO55103 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrxO55103 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrxO55103 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrxO55103 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrxO55103 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrxO55103 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrxO55103 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrxO55103 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrxO55103 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrxO55103 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PrxO55103 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PrxO55103 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrxO55103 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrxO55103 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrxO55103 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrxO55103 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrxO55103 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrxO55103 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrxO55103 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrxO55103 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrxO55103 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrxO55103 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrxO55103 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrxO55103 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PrxO55103 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PrxO55103 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrxO55103 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrxO55103 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrxO55103 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrxO55103 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrxO55103 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrxO55103 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrxO55103 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PrxO55103 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrxO55103 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrxO55103 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrxO55103 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrxO55103 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PrxO55103 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrxO55103 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrxO55103 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrxO55103 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrxO55103 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrxO55103 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrxO55103 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrxO55103 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrxO55103 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PrxO55103 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrxO55103 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PrxO55103 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrxO55103 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrxO55103 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrxO55103 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrxO55103 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrxO55103 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrxO55103 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrxO55103 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PrxO55103 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrxO55103 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrxO55103 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrxO55103 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrxO55103 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrxO55103 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrxO55103 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrxO55103 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrxO55103 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrxO55103 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrxO55103 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrxO55103 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrxO55103 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrxO55103 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrxO55103 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrxO55103 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PrxO55103 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrxO55103 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrxO55103 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms