Protein–RNA interactions for Protein: O54965

Rnf13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf13O54965 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rnf13O54965 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rnf13O54965 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rnf13O54965 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rnf13O54965 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rnf13O54965 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf13O54965 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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