Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdh16O54909 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms