Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DffaO54786 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DffaO54786 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DffaO54786 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DffaO54786 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DffaO54786 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DffaO54786 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DffaO54786 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DffaO54786 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DffaO54786 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DffaO54786 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DffaO54786 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DffaO54786 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DffaO54786 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DffaO54786 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DffaO54786 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DffaO54786 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DffaO54786 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DffaO54786 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DffaO54786 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DffaO54786 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DffaO54786 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DffaO54786 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DffaO54786 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DffaO54786 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DffaO54786 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DffaO54786 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DffaO54786 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DffaO54786 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DffaO54786 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DffaO54786 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DffaO54786 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DffaO54786 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DffaO54786 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DffaO54786 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DffaO54786 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DffaO54786 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DffaO54786 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DffaO54786 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DffaO54786 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DffaO54786 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DffaO54786 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DffaO54786 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DffaO54786 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DffaO54786 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DffaO54786 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DffaO54786 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DffaO54786 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DffaO54786 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DffaO54786 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DffaO54786 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DffaO54786 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DffaO54786 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DffaO54786 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DffaO54786 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DffaO54786 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DffaO54786 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DffaO54786 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DffaO54786 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DffaO54786 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DffaO54786 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DffaO54786 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DffaO54786 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DffaO54786 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DffaO54786 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DffaO54786 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DffaO54786 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DffaO54786 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DffaO54786 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DffaO54786 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DffaO54786 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DffaO54786 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DffaO54786 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DffaO54786 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DffaO54786 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DffaO54786 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DffaO54786 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DffaO54786 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DffaO54786 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DffaO54786 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DffaO54786 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DffaO54786 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DffaO54786 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DffaO54786 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DffaO54786 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DffaO54786 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DffaO54786 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DffaO54786 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DffaO54786 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DffaO54786 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DffaO54786 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DffaO54786 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DffaO54786 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DffaO54786 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DffaO54786 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DffaO54786 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DffaO54786 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DffaO54786 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DffaO54786 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DffaO54786 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms