Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb10O35955 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms