Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tnfrsf18O35714 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf18O35714 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf18O35714 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf18O35714 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf18O35714 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf18O35714 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf18O35714 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf18O35714 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf18O35714 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf18O35714 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf18O35714 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf18O35714 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf18O35714 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf18O35714 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf18O35714 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf18O35714 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf18O35714 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf18O35714 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf18O35714 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf18O35714 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf18O35714 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf18O35714 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf18O35714 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf18O35714 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf18O35714 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf18O35714 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf18O35714 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf18O35714 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf18O35714 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf18O35714 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf18O35714 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf18O35714 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf18O35714 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms