Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn6O35646 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn6O35646 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn6O35646 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn6O35646 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn6O35646 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn6O35646 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms