Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc1a6O35544 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms