Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms