Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms