Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f3O35261 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f3O35261 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f3O35261 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f3O35261 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f3O35261 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f3O35261 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f3O35261 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f3O35261 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f3O35261 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f3O35261 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f3O35261 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f3O35261 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2f3O35261 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2f3O35261 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2f3O35261 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2f3O35261 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2f3O35261 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E2f3O35261 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms