Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad6O35182 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad6O35182 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smad6O35182 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad6O35182 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad6O35182 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad6O35182 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad6O35182 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smad6O35182 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms