Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Kcns1O35173 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kcns1O35173 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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