Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Polr1aO35134 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Polr1aO35134 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms