Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Eftud2O08810 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms