Protein–RNA interactions for Protein: O08785

Clock, Circadian locomoter output cycles protein kaput, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClockO08785 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClockO08785 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClockO08785 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClockO08785 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClockO08785 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ClockO08785 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClockO08785 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClockO08785 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClockO08785 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClockO08785 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClockO08785 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClockO08785 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClockO08785 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClockO08785 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClockO08785 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClockO08785 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClockO08785 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClockO08785 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClockO08785 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClockO08785 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClockO08785 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClockO08785 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClockO08785 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClockO08785 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClockO08785 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClockO08785 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ClockO08785 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ClockO08785 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClockO08785 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClockO08785 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClockO08785 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClockO08785 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClockO08785 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClockO08785 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClockO08785 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClockO08785 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClockO08785 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClockO08785 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClockO08785 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClockO08785 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClockO08785 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClockO08785 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClockO08785 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClockO08785 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClockO08785 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClockO08785 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClockO08785 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClockO08785 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClockO08785 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClockO08785 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClockO08785 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClockO08785 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClockO08785 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClockO08785 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClockO08785 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ClockO08785 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ClockO08785 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClockO08785 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClockO08785 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClockO08785 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClockO08785 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClockO08785 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClockO08785 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClockO08785 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClockO08785 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClockO08785 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClockO08785 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClockO08785 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClockO08785 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClockO08785 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClockO08785 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClockO08785 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClockO08785 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClockO08785 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClockO08785 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClockO08785 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClockO08785 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClockO08785 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClockO08785 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClockO08785 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClockO08785 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClockO08785 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClockO08785 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClockO08785 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClockO08785 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ClockO08785 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClockO08785 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClockO08785 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClockO08785 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ClockO08785 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ClockO08785 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ClockO08785 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ClockO08785 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClockO08785 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClockO08785 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ClockO08785 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClockO08785 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClockO08785 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClockO08785 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClockO08785 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms