Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MttpO08601 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MttpO08601 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MttpO08601 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
MttpO08601 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MttpO08601 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MttpO08601 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MttpO08601 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MttpO08601 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MttpO08601 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MttpO08601 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MttpO08601 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MttpO08601 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MttpO08601 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MttpO08601 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
MttpO08601 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MttpO08601 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MttpO08601 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MttpO08601 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MttpO08601 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MttpO08601 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MttpO08601 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MttpO08601 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MttpO08601 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MttpO08601 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MttpO08601 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MttpO08601 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MttpO08601 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MttpO08601 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MttpO08601 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MttpO08601 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MttpO08601 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MttpO08601 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MttpO08601 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MttpO08601 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MttpO08601 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MttpO08601 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MttpO08601 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MttpO08601 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MttpO08601 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MttpO08601 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MttpO08601 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MttpO08601 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MttpO08601 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MttpO08601 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MttpO08601 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MttpO08601 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MttpO08601 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MttpO08601 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MttpO08601 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MttpO08601 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MttpO08601 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MttpO08601 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MttpO08601 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MttpO08601 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MttpO08601 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MttpO08601 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MttpO08601 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MttpO08601 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MttpO08601 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MttpO08601 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MttpO08601 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MttpO08601 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MttpO08601 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MttpO08601 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MttpO08601 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MttpO08601 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MttpO08601 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MttpO08601 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MttpO08601 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MttpO08601 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MttpO08601 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MttpO08601 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MttpO08601 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MttpO08601 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MttpO08601 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MttpO08601 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MttpO08601 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MttpO08601 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MttpO08601 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MttpO08601 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MttpO08601 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MttpO08601 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MttpO08601 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MttpO08601 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MttpO08601 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MttpO08601 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MttpO08601 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MttpO08601 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MttpO08601 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MttpO08601 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MttpO08601 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MttpO08601 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MttpO08601 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MttpO08601 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MttpO08601 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MttpO08601 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MttpO08601 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MttpO08601 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MttpO08601 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms