Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gm3239L7N2D9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gm3239L7N2D9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Gm3239L7N2D9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Gm3239L7N2D9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Gm3239L7N2D9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Gm3239L7N2D9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Gm3239L7N2D9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Gm3239L7N2D9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Gm3239L7N2D9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Gm3239L7N2D9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm3239L7N2D9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm3239L7N2D9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gm3239L7N2D9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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