Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm21310J3QQ23 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm21310J3QQ23 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm21310J3QQ23 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm21310J3QQ23 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm21310J3QQ23 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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