Protein–RNA interactions for Protein: J3QPW6

1700122O11Rik, MCG53587, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700122O11RikJ3QPW6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
1700122O11RikJ3QPW6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700122O11RikJ3QPW6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms