Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Smim18J3QNP2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Smim18J3QNP2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms