Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc180J3QNE4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc180J3QNE4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms