Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms