Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem200cJ3QK46 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms