Protein–RNA interactions for Protein: J3QK38

Gm21244, MCG116195, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21244J3QK38 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21244J3QK38 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21244J3QK38 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21244J3QK38 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21244J3QK38 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21244J3QK38 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21244J3QK38 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21244J3QK38 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms