Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms