Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pabpc4lG5E8X2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms