Protein–RNA interactions for Protein: G5E8H9

Rdh19, MCG134493, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh19G5E8H9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh19G5E8H9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh19G5E8H9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh19G5E8H9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh19G5E8H9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh19G5E8H9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh19G5E8H9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh19G5E8H9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh19G5E8H9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh19G5E8H9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh19G5E8H9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh19G5E8H9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh19G5E8H9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh19G5E8H9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh19G5E8H9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh19G5E8H9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh19G5E8H9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh19G5E8H9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh19G5E8H9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh19G5E8H9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh19G5E8H9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh19G5E8H9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh19G5E8H9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh19G5E8H9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh19G5E8H9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh19G5E8H9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdh19G5E8H9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdh19G5E8H9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdh19G5E8H9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdh19G5E8H9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdh19G5E8H9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdh19G5E8H9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdh19G5E8H9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh19G5E8H9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms