Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4933406M09RikG3XA12 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms