Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms