Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Speer4cG3UXD1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Speer4cG3UXD1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms