Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Ercc6F8VPZ5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms