Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Colca2F8VPY8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms