Protein–RNA interactions for Protein: F7BE84

Ankrd50, Ankyrin repeat domain 50 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd50F7BE84 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd50F7BE84 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd50F7BE84 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd50F7BE84 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd50F7BE84 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd50F7BE84 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd50F7BE84 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd50F7BE84 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd50F7BE84 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd50F7BE84 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd50F7BE84 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd50F7BE84 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd50F7BE84 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd50F7BE84 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd50F7BE84 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd50F7BE84 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd50F7BE84 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd50F7BE84 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd50F7BE84 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd50F7BE84 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd50F7BE84 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd50F7BE84 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd50F7BE84 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd50F7BE84 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd50F7BE84 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd50F7BE84 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd50F7BE84 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd50F7BE84 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd50F7BE84 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd50F7BE84 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd50F7BE84 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd50F7BE84 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd50F7BE84 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd50F7BE84 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms