Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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