Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Igkv1-99F6XWB2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Igkv1-99F6XWB2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms