Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Zfp988F6VKC7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Zfp988F6VKC7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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