Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933403O08RikF6UK53 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933403O08RikF6UK53 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms