Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Gm28305F6U473 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm28305F6U473 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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