Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Raph1F2Z3U3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms